三年前太空飛船獵戶號(hào)墜毀學(xué)園都市，由此引發(fā)了嚴(yán)重的慘劇，而該事件也促成宇宙電梯恩底彌翁（Endymion）的建設(shè)。在恩底彌翁接近完工的前夕，上條當(dāng)麻（阿部敦配音）和茵蒂克絲（井口裕香配音）揭示了熱愛(ài)歌唱的少女鳴護(hù)亞麗莎。心懷夢(mèng)想的亞麗莎經(jīng)過(guò)不斷的修業(yè)和努力，終于得到了試鏡的機(jī)會(huì)，并有可能在恩底彌翁落成的慶祝活動(dòng)中演唱。這一晚，當(dāng)麻、茵蒂克絲和亞麗莎在夜歸途中遭到史提爾率領(lǐng)的魔法師們的攻擊。而學(xué)園都市秩序維持部隊(duì)的介入，無(wú)疑標(biāo)志著魔法側(cè)和科學(xué)側(cè)全面戰(zhàn)爭(zhēng)即將爆發(fā)。亞麗莎的體內(nèi)究竟隱藏著怎樣的力量和秘密……本片根據(jù)鐮池和馬（創(chuàng)作）、灰村清孝（插畫）的輕小說(shuō)改編。